Table of Contents
1 ?Mega畫樹的簡(jiǎn)單應(yīng)用
2 ?fas格式文件的準(zhǔn)備
首先我們要準(zhǔn)備的就是fas的需要進(jìn)行畫樹的序列。這個(gè)自己根據(jù)需要生成。 我們用mega打開fas的文件，然后用mega進(jìn)行格式轉(zhuǎn)換。Data->Export Al ignmetn->MEGA Format.
3 ?用生成的.meg畫樹
雙擊打開.meg文件。然后找到Phylogeny->Construct/Test Neighbor-Joi ning Tree->yes(use current data)->修改參數(shù)->Test of Phylogeny( Bootstrap method)->Na of Bootstrap Replication(1000)->Model/Me thod(p-distance)->Substitutions to Include(d:Transitions+Trans versions)->Gaps/Missing Data Treatment(Pairwise deletion).然后 Compute。很快就畫好了。
4 ?生出樹的處理
在畫樹完成以后，我們可以看到兩個(gè)圖，第一個(gè)叫做Original Tree 還有一 個(gè)是Bootstrap consensus tree。
4.1 ?修改內(nèi)容，添加標(biāo)注
這里所有的修改都在view->Tree options中。
4.2 ?導(dǎo)出
在Image中中我們可以導(dǎo)出PDF或者PNG格式的圖片。
4.3 ?后面隨著學(xué)習(xí)的進(jìn)行繼續(xù)修改，增加。
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